Los Videos Musicales se produjeron por primera vez durante la tercera temporada en 1992. Estos videos presentaban sus propias canciones, principalmente cantadas por coros de niños británicos locales, con los veteranos de la serie de televisión Mike O'Donnell y Junior Campbell ocasionalmente dando coros o tomando la iniciativa. Desde La Leyenda del Tesoro Perdido, los personajes han cantado algunas canciones, un formato que los especiales usan exclusivamente. De 1994 a 2003, las canciones se basaron en las melodías temáticas de un personaje, lugar o tipo de trabajo específico que harían las locomotoras, que fueron compuestos por Mike O'Donnell y Junior Campbell. Varios han sido lanzados en CD como libros con audio o álbumes de música. Al final de muchos episodios de "La Estación de la Alegría", "El Himno de Thomas" se reproduciría durante los créditos finales en lugar de "Shining Time Station Theme Song". La mini serie spin off "Las Aventuras de Thomas del Señor Conductor" fue una mezcla de los que no se muestran en ningún episodio de "La Estación de la Alegría". "Las Aventuras de Thomas del Señor Conductor" se emitió el 6 de Octubre de 1996 y terminó el 11 de Noviembre de 1996. La serie duró seis episodios. "Las Aventuras de Thomas del Señor Conductor" protagonizó al difunto George Carlin como el Señor Conductor.
Después de que O'Donnell y Campbell abandonaron la serie después de veinte años, Robert Hartshorne comenzó a componer la música para la serie, mientras que Ed Welch escribió las canciones, ambas a partir de la octava temporada en 2004. Welch se fue en 2009, dejando a Hartshorne para hacerse cargo de la composición de las canciones. En 2011, Peter Hartshorne, el hijo de Robert, lo ayudó a apuntar Día de los Diésel. Los Hartshornes abandonaron el programa después de que sus contratos terminaron en 2015 y Chris Renshaw y Oliver Davis asumieron el cargo de compositores. Steve D'Angelo y su compañía Eggplant LF componen, escriben y producen canciones para la serie de televisión mientras Davis compone y produce canciones para los especiales.
Los videos musicales son conocidos por usar clips de la serie junto con escenas eliminadas que no se verían en los episodios. Algunos videos musicales tienen imágenes grabadas especialmente, lo que solo sucedería si la canción no tuviera los clips requeridos de los archivos.
Temporada 3
- El Himno de Thomas (versión 1; con escenas de la Temporada 3 solamente)
- Soy Thomas la Locomotora (solo para Japón; Thomas y el Viaje al Reino Unido)
Temporada 4
- El Himno de Thomas (versión 2; con escenas de las temporadas 1-4)
- Ven a Correr
- De Pesca
- Toby
- Con Sólo Ver Su Portada
- La Isla de Sodor
- Viene y Va
- La Canción de Navidad de Thomas (solo en VHS; solo en el Reino Unido)
Temporada 5
- El Tren de la Noche
- Un Accidente Puede Ocurrir
- Pronto el Sol Verás Brillar
- Me Gusta ser Locomotora
- La Canción de la Nieve
- El Pato de Donald
- Sir Topham Hatt
- Rock del Andén
- Harold
- Vamos con Percy a la Playa
Thomas y el Ferrocarril Mágico
- Un Motor que es de Gran Utilidad
- Tiempo Brillante
- Ya sé la Luna Siente / Como la Luna Sentimiento
- The Locomotion
- Algunas Cosas Nunca te Dejan
- Summer Sunday
- La Canción de los Silbidos *borrador inicial* (no en el corte final)
- El Tren de la Noche (no en corte final)
- La Isla de Sodor (guión original)
- El Himno de Thomas (guión original)
Temporada 6
- James la Locomotora Realmente Espléndida
- Pequeñas Locomotoras
- En el Puerto
- Las Maravillas del Invierno
- ¡Boo! ¡Boo! Choo-Choo
- Nunca te Rindas
Temporada 7
- Cinco Nuevas Locomotoras en el Cobertizo
- El Globo Rojo
- Había una Vez una Locomotora que Huyó
- Los Furgones Problemáticos
- Salty
- La Canción de los Silbidos
Temporada 8
- Sonidos
- Emily
- Sorpresas
- Un Mundo Que te Rodea
- Determinación
- Paciente
- Una Canción a Gordon
- La Ronda de Nombres
¡Llamando a Todas las Locomotoras!
- Corremos
- Diésel y Vapor
- Unidos
- La Segunda Ronda de Nombres
- La Canción de los Sueños (característica bonus del DVD)
Temporada 9
- Thomas la Locomotora Valiente
- Día y Noche
- La Fiesta ya Llegó
- Orgullo
- Cada Día es Especial en Sodor
- Hay Que Compartir
- Unión
Jack y la Compañía Constructora de Sodor
- La Canción del Trabajo
- Una Familia Amigable
Temporada 10
- Hacerlo Bien
- Un Lugar Favorito
- H de Harold
- Navegación
- Hay Algo Nuevo
- Feliz y Triste
- Fuerza
- ¡¡Vamos!! Thomas (Japón y With Thomas: Work and Dance!! solo con Tomiya Hasegawa; solo doblado en Japonés)
- Jingle Bells (solamente en Japón y La Navidad de Thomas; solo con escenas de pantalla completa, con diferentes compositores; solo dobladas en Japonés)
- Rodolfo, el Reno de la Nariz Roja (solamente en Japón y La Navidad de Thomas; solo con escenas de pantalla completa, con diferentes compositores; solo dobladas en Japonés)
- La Ronda de Nombres (versión Rock 'n' Roll)
Temporada 11
- Las Locomotoras de Vías Estrechas
- La Ronda de Nombres (alta definición/re-grabado)
El Gran Descubrimiento
- Thomas y James Corren
- Trabajemos
- ¿Donde Está Thomas?
- La Ronda de Nombres (Alterado con "Gordon corre sin cesar", "Henry y Edward, silban sin parar" y "Stanley, él llegó recién")
- Es el Líder
Temporada 12
- La Ronda de Nombres (versión con cara CGI)
El Héroe de las Vías
Temporada 13
- A Rodar
- Thomas, Eres Líder (versión CGI; Stanley, El Paquete, y el Ferrocarril Skarloey eliminados)
- Sonidos (versión CGI)
- Determinación (versión CGI)
- La Ronda de Nombres (versión CGI)
Rescate de la Isla Misteriosa
Temporada 14
- Lo Único que Necesitas son Amigos
- Sir Topham Hatt
Día de los Diésel
Temporada 15
- Locomotoras Llegando
El Misterio de la Montaña Azul
Temporada 16
- Thomas y Percy
- Corre Thomas (letra y escenas diferentes)
El Rey de las Vías
- Todos Trabajen (letra y escenas diferentes)
- Busca en Todo Lugar
- Va a Ser un Día Especial
Temporada 17
Misterio en las Vías
Temporada 18
- Ya es Navidad
- Tren de la Amistad
Thomas' YouTube World Tour
- Un Mundo Que te Rodea (versión CGI)
- En el Puerto (CGI version)
- Navegación (versión CGI)
- Nunca te Rindas (versión CGI)
- Me Gusta ser Locomotora (versión CGI)
- El Himno de Thomas (versión CGI)
- La Isla de Sodor (versión CGI)
- La Canción de los Silbidos (versión CGI)
- El Tren de la Noche (versión CGI)
- Una Canción a Gordon (versión CGI)
- Reglas
- Para Eso Son los Amigos
La Aventura Comienza
- Es Realmente Útil (diferentes cantantes, letra y escenas)
- Los Vagones Traviesos (diferentes cantantes, letra y escenas)
Temporada 19
- No Hay Lugar Helado como el Hogar
- ¡Vamos!
- La Gran Carrera
- La Primavera Está Aquí
- La Ronda de Nombres (nuevo arreglo y escenas)
- En el Puerto (nuevo arreglo)
La Leyenda del Tesoro Perdido
Temporada 20
- El Deseo de Navidad de Glynn
- Es Halloween
- James la Locomotora Realmente Espléndida (versión CGI)
- Un Accidente Puede Ocurrir (versión CGI)
La Gran Carrera
- A la Gran Carrera nos Debe Llevar
- Aerodinámico
- Estoy Lleno de Sorpresas
- Sólo Puedes Ser Tú
- Más Rápido lo Has Visto Tú
- Se Tú y Verás, Lejos Llegarás
- Está Lleno de Sorpresas
El Viaje Más Allá de Sodor
- Hay Que Elegir al Favorito
- ¿Quién es Thomas?
- No Hay Sitio Más Caliente Aquí
- Yo Quiero ir a mi Hogar
- Ya, Así Soy
- Lo Principal es Siempre la Amistad
Temporada 21
- La Amistad en Movimiento
- Hacerlo Bien (versión CGI)
- Diésel y Vapor (versión CGI)
- Pequeñas Locomotoras (versión CGI)
Un Gran Mundo de Aventuras
- En Cualquier Parte Pudiera Estar Thomas
- ¡Despierta!
- Enda Ulale
- Amistad
- Libre y Fácil
- Haces Una Amistad
Temporada 22
- Un Gran Mundo de Aventuras (tema principal)
- El Viajar Jamás Va a Terminar
- La Ronda de Nombres (Nia y Rebecca reemplazan a Edward y Henry, todo lo demás se volvió a grabar)
- Todas las Chicas del Mundo
- El Equipo de Vapor
- A Soñar
Temporada 23
- La Leyenda de la Locomotora Perdida
- El Equipo de Construcción de Sodor
- No te Detengas
Temporada 24
- Tren de Fiesta
- ¿Cómo es Que Funciona?